基础医学院现有研究生课程包括《应用解剖学》、《分子病理学》、《病原生物学进展》、《高级病理生理学》、《形态学技术》（双语教学）、《高级免疫学》、《实验室生物安全》、《肿瘤分子遗传学》、《医学分子生物学》、《医学分子生物学实验技术》、《生物信息学》、《神经科学》（双语教学）、《医学论文写作与指导》、《医学实验动物学》、《医学生理学》、《科学道德与学术规范》以及《系统生物学》17门课程。

省级研究生精品课程3门： 医学分子生物学实验技术，形态学技术，分子病理学。

校级研究生精品课程建设项目3项：神经科学、形态学技术、医学分子生物学实验技术。

黑龙江省研究生课程思政示范课程2门：高级病理生理学-陈培、分子病理学-郭素芬。

黑龙江省研究生课程思政课程1门：形态学技术（双语教学）。

校级研究生课程思政示范课程建设项目3项：分子病理学、生物信息学、医学分子生物学实验技术。

黑龙江省研究生课程思政教学案例建设项目5项：生物信息学、高级免疫学、实验室生物安全、医学分子生物学实验技术、形态学技术（双语教学）。

黑龙江省首届高等学校课程思政教学竞赛二等奖1项 ：高级病理生理学。

黑龙江省研究生教学改革项目 2 项：重点项目1项； 一般项目1项（2022）。省部级教学成果二等奖 1 项 。